45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2128 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  323  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  90.91 
 
 
165 aa  282  1e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  60.51 
 
 
157 aa  207  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  42.58 
 
 
154 aa  141  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  36.77 
 
 
152 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  38.06 
 
 
150 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  43.97 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  43.97 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  35.62 
 
 
145 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  35.04 
 
 
143 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  43.24 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  34.25 
 
 
145 aa  83.6  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  31.58 
 
 
151 aa  82.8  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  32.88 
 
 
145 aa  79.7  2e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  78.6  3e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  33.12 
 
 
148 aa  65.5  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  59.7  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  33.55 
 
 
150 aa  58.5  4e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.99 
 
 
147 aa  57  1e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  51.6  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  31.88 
 
 
147 aa  48.5  4e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
150 aa  48.1  5e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  47.8  6e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.79 
 
 
144 aa  48.1  6e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.89934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  47.4  9e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  47.4  9e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  25.53 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  25.53 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  33.78 
 
 
121 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  23.13 
 
 
152 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  26.9 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.25 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  24.32 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  39.73 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.33 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  30.19 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  24.84 
 
 
143 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  27.67 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  26.57 
 
 
148 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.68 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  30.16 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>