More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2034 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  97.53 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  71.56 
 
 		 275 aa  345  3e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.43 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  41.73 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  43.57 
 
 		 268 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  42.68 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  42.68 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  43.33 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  43.51 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  43.51 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  43.51 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  43.33 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  44.4 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  44.39 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  43.1 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  39.77 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  45.5 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  46.26 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  47.09 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  43.53 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  40.59 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  43.53 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  43.53 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  44.93 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  44.93 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  44.44 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 298 aa  184  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  43.95 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  41.28 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  43.5 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  44.04 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  38.63 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  43.12 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  42.41 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  40 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  40.09 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  45.54 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  38.5 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  37.92 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  38.2 
 
 		 303 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  40.18 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  40.09 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  39.63 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  40.44 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  42.4 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  39.5 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  39.82 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  35.19 
 
 		 217 aa  168  8e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  38.63 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  41.01 
 
 		 283 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  37.45 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  37.02 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.31 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  36.75 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.07 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.64 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.76 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  31.78 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  31.49 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  33.19 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1074  ABC transporter related  30.67 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.281919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  31.82 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  31.82 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  36 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  33.2 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  35.48 
 
 		 308 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.29 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  30.59 
 
 		 259 aa  124  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.15 
 
 		 258 aa  124  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  28.22 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  33.64 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  33.74 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.78 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  32.62 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  32.14 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>