More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1989 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  99.07 
 
 
120 aa  222  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  79.63 
 
 
108 aa  189  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  59.8 
 
 
107 aa  147  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  62 
 
 
107 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  62 
 
 
124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  59 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  59 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  59 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  58 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  61 
 
 
107 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  58 
 
 
109 aa  143  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  59 
 
 
125 aa  143  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57 
 
 
148 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  57.28 
 
 
107 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  57.94 
 
 
109 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  57 
 
 
107 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  57 
 
 
107 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  58 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  57 
 
 
123 aa  137  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  57.94 
 
 
110 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59 
 
 
115 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50.93 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  56.48 
 
 
108 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  53.7 
 
 
108 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.79 
 
 
107 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  55.14 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  55.24 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  60.58 
 
 
104 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  60.58 
 
 
104 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.37 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.78 
 
 
108 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  55.77 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56.57 
 
 
106 aa  130  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  59.62 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  60.2 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  59.55 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  54.21 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50.47 
 
 
259 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  50 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  53.27 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  127  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.21 
 
 
109 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  57.73 
 
 
107 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  51.4 
 
 
109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  58.25 
 
 
106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  56.48 
 
 
109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  53.7 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  51.4 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  51.4 
 
 
109 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.93 
 
 
109 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  127  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  49.07 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  49.07 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  50.93 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  53.27 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  126  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  53.27 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  52.94 
 
 
259 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  56.57 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  52.34 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  57 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  51.4 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  53.27 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>