More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1938 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  96.63 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  92.31 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  63.73 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  57.29 
 
 		 201 aa  257  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  61.81 
 
 		 198 aa  257  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  61.34 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  61.05 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  61.05 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  61.26 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  58.76 
 
 		 200 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  59.28 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  58.97 
 
 		 200 aa  248  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  61.78 
 
 		 199 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  59.49 
 
 		 197 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  56.92 
 
 		 200 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  60.53 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  57.14 
 
 		 199 aa  241  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  58.21 
 
 		 200 aa  241  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  57.58 
 
 		 192 aa  240  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  57.58 
 
 		 192 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  57.73 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.87 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  60 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  58.46 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  56.06 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  59.16 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  59.16 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  59.18 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  57.95 
 
 		 193 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  58.33 
 
 		 205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  58.38 
 
 		 193 aa  231  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  56.63 
 
 		 193 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  57.44 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 193 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  57.89 
 
 		 193 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  57.89 
 
 		 193 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  55.61 
 
 		 198 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  57.89 
 
 		 193 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  57.37 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  53.61 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  57.37 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  53.96 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  55.9 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  56.41 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  56.12 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 194 aa  224  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  57.59 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  57.59 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  56.12 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  52.28 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  57.59 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  56.12 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  55.61 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  56.63 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  57.59 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  54.59 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  56.12 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 221 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 199 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  56.25 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  54.69 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  56.54 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  54.04 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  55.21 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  55.21 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  55.73 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  54.04 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  54.69 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  52.79 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  52 
 
 		 194 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>