More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1910 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  100 
 
 
339 aa  697    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  93.22 
 
 
339 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  63.53 
 
 
341 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  42.9 
 
 
328 aa  262  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  41.16 
 
 
331 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 
330 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  37.84 
 
 
327 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  37.84 
 
 
327 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  38.1 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  33.44 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.33 
 
 
328 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  34.16 
 
 
333 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  34.47 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  34.23 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  33.02 
 
 
348 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  33.64 
 
 
342 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  30.84 
 
 
338 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  31.58 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  31.58 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 
329 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
331 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  33.33 
 
 
337 aa  165  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  31.07 
 
 
336 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  32.4 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  32.42 
 
 
330 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  32.2 
 
 
330 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  31.89 
 
 
333 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  30.56 
 
 
330 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
337 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 
330 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  31.2 
 
 
332 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  31.69 
 
 
330 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
328 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.82 
 
 
333 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.14 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  32.33 
 
 
333 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  30.56 
 
 
335 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  29.94 
 
 
335 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 
338 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  31.89 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  31.58 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  31.89 
 
 
333 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  32.82 
 
 
333 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  30.25 
 
 
330 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  32.12 
 
 
360 aa  142  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  31.36 
 
 
331 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  31.27 
 
 
335 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  31.27 
 
 
331 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  31.14 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 
331 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  29.72 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 
334 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  29.45 
 
 
331 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  29.54 
 
 
333 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.57 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  27.96 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 
335 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 
333 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  28.06 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.12 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.51 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.1 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.69 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  28.21 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.21 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.21 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.21 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.89 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.57 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.5 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.68 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.2 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.09 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  25.27 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  25.87 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.1 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.48 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.21 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.15 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  27.27 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.21 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.37 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.37 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.38 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  26.74 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>