More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1909 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1909  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
319 aa  654    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848653  hitchhiker  0.0046163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2199  hypothetical protein  95.28 
 
 
318 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00171139  decreased coverage  0.00853056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  69.58 
 
 
309 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  50.48 
 
 
289 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  50 
 
 
293 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.2 
 
 
299 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.27 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  49.68 
 
 
287 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.04 
 
 
272 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  44.79 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  49.51 
 
 
280 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.32 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.9 
 
 
280 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.32 
 
 
291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  46.91 
 
 
281 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.32 
 
 
291 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  47.39 
 
 
280 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  46.25 
 
 
287 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  48.2 
 
 
287 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  50 
 
 
281 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  49.67 
 
 
281 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  49.51 
 
 
287 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  49.67 
 
 
281 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  49.35 
 
 
281 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  45.28 
 
 
286 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.22 
 
 
287 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.39 
 
 
280 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.39 
 
 
280 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  48.39 
 
 
282 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  48.39 
 
 
320 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.87 
 
 
280 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  46.98 
 
 
265 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.54 
 
 
280 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.54 
 
 
280 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.87 
 
 
280 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  48.68 
 
 
280 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.87 
 
 
280 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  45.19 
 
 
288 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  46.58 
 
 
280 aa  252  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  44.98 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  44.98 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  44.98 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  44.98 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  45.13 
 
 
286 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.13 
 
 
286 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.31 
 
 
299 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  45.4 
 
 
281 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  45.13 
 
 
286 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2203  hypothetical protein  47.18 
 
 
282 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.826131  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  45.31 
 
 
299 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.81 
 
 
286 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  45.13 
 
 
286 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  45.31 
 
 
299 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  44.81 
 
 
286 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  46.86 
 
 
273 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  44.66 
 
 
287 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.53 
 
 
273 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  43.52 
 
 
281 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  44.48 
 
 
286 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.02 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  43.85 
 
 
306 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.55 
 
 
292 aa  242  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.44 
 
 
286 aa  241  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.48 
 
 
295 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.81 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  45.31 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  43.85 
 
 
301 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.48 
 
 
295 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.18 
 
 
320 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.69 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0326  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.55 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.98 
 
 
288 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.75 
 
 
305 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.42 
 
 
305 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.27 
 
 
278 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.13 
 
 
287 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.36 
 
 
282 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  42.9 
 
 
292 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0177  tetrapyrrole methylase family protein  43.09 
 
 
285 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0897585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0171  tetrapyrrole methylase family protein  43.09 
 
 
285 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  40.91 
 
 
291 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.75 
 
 
291 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  43.18 
 
 
281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  42.24 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  44.01 
 
 
285 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  43.73 
 
 
285 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.41 
 
 
303 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  43.55 
 
 
281 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  40.88 
 
 
292 aa  219  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  39.87 
 
 
293 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  42.77 
 
 
279 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  40 
 
 
291 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2211  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.99 
 
 
293 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.165354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  40.44 
 
 
354 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.37 
 
 
295 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.49 
 
 
293 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  43.37 
 
 
293 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.81 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.12 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>