More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1894 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  3.03162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  652  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  656  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  656  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4468  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.22056e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  652  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.5318e-08  hitchhiker  3.10582e-11 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  652  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.50336e-07  hitchhiker  1.30036e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  82.28 
 
 
394 aa  649  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.53651e-06  unclonable  9.37964e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  82.28 
 
 
394 aa  649  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.63397e-08  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  652  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.06645e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  78.43 
 
 
396 aa  646  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  78.43 
 
 
396 aa  646  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  645  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.75684e-07  hitchhiker  1.48389e-10 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  77.92 
 
 
396 aa  640  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  2.6192e-12  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  4.68547e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  78 
 
 
402 aa  642  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  78.93 
 
 
396 aa  646  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.41 
 
 
396 aa  634  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  2.68752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3715  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal  0.317653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4478  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00401398  decreased coverage  9.87453e-15 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0146  elongation factor Tu  81.73 
 
 
394 aa  640  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.78684e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0134  elongation factor Tu  81.73 
 
 
394 aa  638  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  6.37762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3750  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.624959  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4475  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000136907  hitchhiker  0.00081274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  659  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  79.24 
 
 
397 aa  636  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.67002e-10  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.41 
 
 
396 aa  634  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  79.7 
 
 
396 aa  655  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  2.8539e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  79.7 
 
 
396 aa  655  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.50197e-05  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  674  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.14684e-06  hitchhiker  3.34083e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  674  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.02802e-06  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  4.26715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  79.24 
 
 
397 aa  636  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  674  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.49049e-06  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4519  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  635  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.4313e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0182  elongation factor Tu  82.74 
 
 
394 aa  634  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.14209e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  79.24 
 
 
397 aa  636  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  79.24 
 
 
400 aa  637  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  78.02 
 
 
407 aa  640  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.89642e-06  unclonable  6.40465e-12 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2043  elongation factor Tu  93.91 
 
 
396 aa  725  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.75899e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1860  elongation factor Tu  93.65 
 
 
396 aa  723  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.59791e-08  hitchhiker  0.00222583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.76048e-05  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.75004e-09  hitchhiker  9.74336e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0194  elongation factor Tu  82.74 
 
 
394 aa  634  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.23717e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  79.7 
 
 
396 aa  652  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4213  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  634  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.91099e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  640  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.3337e-07  unclonable  1.08013e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  81.73 
 
 
394 aa  634  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.76369e-08  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  82.49 
 
 
394 aa  637  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.12961e-08  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  80.96 
 
 
394 aa  634  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  80.96 
 
 
394 aa  634  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.66988e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0198  elongation factor Tu  82.74 
 
 
394 aa  634  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.78702e-07  unclonable  1.27922e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  79.7 
 
 
396 aa  653  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  81.73 
 
 
394 aa  641  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.01844e-07  unclonable  3.72179e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  81.73 
 
 
394 aa  640  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.92421e-07  hitchhiker  3.9393e-05 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  7.12008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.63409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.73215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4172  elongation factor Tu  82.74 
 
 
394 aa  634  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.6716e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4468  elongation factor Tu  82.74 
 
 
394 aa  634  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  81.47 
 
 
394 aa  637  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.95175e-06  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  81.22 
 
 
394 aa  635  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.13949e-06  decreased coverage  5.1786e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  79.75 
 
 
397 aa  638  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  79.75 
 
 
397 aa  638  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  644  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.80335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  644  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.88214e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3756  elongation factor Tu  81.98 
 
 
394 aa  636  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.75435e-06  decreased coverage  0.00120864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0190  elongation factor Tu  81.98 
 
 
394 aa  636  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.35247e-06  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  651  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.52436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  651  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.35478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  9.51262e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  82.23 
 
 
394 aa  659  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.53237e-06  unclonable  2.41033e-11 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03856  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufA)  81.22 
 
 
394 aa  634  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.29508e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0383  elongation factor Tu  100 
 
 
396 aa  807  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00208538  normal  0.193247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1894  elongation factor Tu  100 
 
 
396 aa  807  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  3.75523e-13  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  78.68 
 
 
396 aa  646  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  78.68 
 
 
396 aa  643  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  78.68 
 
 
396 aa  643  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  81.22 
 
 
396 aa  648  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  81.22 
 
 
396 aa  648  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  9.26456e-06  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  635  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  655  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  7.50152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  77.41 
 
 
396 aa  637  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.16 
 
 
396 aa  637  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  77.5 
 
 
402 aa  641  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  1.07296e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4917  elongation factor Tu  78.93 
 
 
397 aa  642  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.34353e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  651  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.80875e-06  normal  0.0858427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>