More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1683 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  90.41 
 
 
219 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  90.83 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  58.39 
 
 
159 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  62.99 
 
 
149 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  66.06 
 
 
159 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  65.79 
 
 
167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  67.89 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  67.89 
 
 
160 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  68.52 
 
 
158 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  68.52 
 
 
158 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  63.48 
 
 
163 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  43.19 
 
 
154 aa  161  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  61.59 
 
 
155 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  68.22 
 
 
160 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  66.67 
 
 
184 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 
181 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 
190 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  63.03 
 
 
151 aa  157  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  64.81 
 
 
162 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  67.57 
 
 
172 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  51.11 
 
 
233 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  57.69 
 
 
175 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  62.18 
 
 
151 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  67.59 
 
 
154 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 
181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 
177 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  61.86 
 
 
185 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
171 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 
178 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  62.04 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  63.64 
 
 
182 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  59.48 
 
 
188 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  65.42 
 
 
185 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  62.73 
 
 
182 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  62.73 
 
 
182 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  62.04 
 
 
187 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  62.73 
 
 
182 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  50.99 
 
 
162 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 
172 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  60.5 
 
 
178 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  62.73 
 
 
180 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  63.64 
 
 
165 aa  149  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  50.27 
 
 
200 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  55.96 
 
 
222 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  61.21 
 
 
165 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  61.21 
 
 
165 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
176 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
176 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  60.91 
 
 
184 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 
177 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 
179 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
176 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
176 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
176 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  59.26 
 
 
214 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  62.04 
 
 
181 aa  147  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 
183 aa  147  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  54.55 
 
 
231 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  62.39 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  57.26 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  55.91 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  61.11 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  60.91 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
183 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
186 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
182 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
184 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
184 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  56.06 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  59.48 
 
 
175 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  58.97 
 
 
150 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  58.88 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  50 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  41.86 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  64.55 
 
 
177 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  64.55 
 
 
177 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
185 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
184 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
179 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
176 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 
178 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  61.82 
 
 
234 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  59.26 
 
 
156 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  50.3 
 
 
168 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>