More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1602 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  30.33 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.88 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  47.71 
 
 		 351 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.01 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.01 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.73 
 
 		 344 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.01 
 
 		 344 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.01 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.57 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.29 
 
 		 350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.29 
 
 		 350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  46.79 
 
 		 327 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.9 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1049  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  34.59 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.547812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.57 
 
 		 466 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.65 
 
 		 429 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 457 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.34 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1023  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  36.02 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 434 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 1755 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 333 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.23 
 
 		 420 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 454 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40 
 
 		 427 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 333 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.1 
 
 		 468 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.61 
 
 		 381 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.74 
 
 		 394 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.58 
 
 		 352 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 432 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.72 
 
 		 337 aa  89.4  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  33.33 
 
 		 367 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  38.4 
 
 		 392 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  45.54 
 
 		 375 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.26 
 
 		 543 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 375 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 466 aa  89  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.27 
 
 		 334 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.53 
 
 		 337 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.62 
 
 		 542 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 		 544 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 403 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.35 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 335 aa  85.9  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 375 aa  85.5  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 209 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  40.57 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  43.93 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.9 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  41.58 
 
 		 1987 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  44 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.22 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  38.68 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  33.91 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  35.4 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  31.79 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  37.74 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 1026 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.31 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  39.84 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>