More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1588 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  95.98 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  67.87 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  62.65 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  63.37 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  58.63 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  60.85 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  56.4 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  58.61 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  58.61 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  55.92 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  53.02 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.59 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  51.26 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  49.79 
 
 		 361 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  49.33 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  49.56 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.56 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 		 357 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  50.21 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  48.71 
 
 		 356 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  49.79 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 		 356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.5 
 
 		 357 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  48.02 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  48.71 
 
 		 356 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  48.7 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  48.46 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  48.46 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.02 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.68 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  45.26 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  44.4 
 
 		 346 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  46.9 
 
 		 229 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  46.9 
 
 		 229 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  50.44 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  43.53 
 
 		 346 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.34 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  48.91 
 
 		 356 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  45.26 
 
 		 344 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  69.63 
 
 		 186 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  46.02 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  46.02 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.33 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.35 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  38.79 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  38.36 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.61 
 
 		 346 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.4 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.2 
 
 		 288 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.78 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  29.86 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 214 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  28.09 
 
 		 288 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  28.09 
 
 		 288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  31.68 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.02 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  39.89 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  28.67 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.95 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  29 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.13 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.96 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.06 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.64 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>