More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1564 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  87.72 
 
 		 228 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0799  putative methyltransferase  44.35 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  43.96 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  40.46 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.61 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.03 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  38.31 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  43.2 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  41.48 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  40.38 
 
 		 199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.24 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.64 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  44.44 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  40 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  47.1 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.24 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  35.47 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  43.64 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.11 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.64 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.64 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.64 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  36.45 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  42.14 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  39.67 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  43.03 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  43.03 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  39.05 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  36.73 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  34.6 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  46.45 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  35.84 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  39.3 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  37.97 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  37.07 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.01 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  35.84 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  35.84 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  35.1 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  38.33 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  35.84 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  39.13 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  37.19 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  41.57 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  41.94 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  40.12 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  42.14 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  42.14 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  44.52 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  37.99 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  39.76 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  33.17 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  39.76 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  38.15 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  40.12 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  41.04 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 		 202 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  38.15 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.3 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  34.63 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  39.16 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  36.45 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  38.76 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  36.79 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  33.66 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  39.33 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  43.59 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  42.61 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  39.05 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  40.33 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.26 
 
 		 199 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  42.86 
 
 		 192 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  33.17 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  34.7 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  36.07 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  33.17 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  36.84 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  35.71 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  35.16 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  34.12 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  39.87 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  38.33 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  38.67 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  37.71 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  34.63 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  36.26 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>