93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1544 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  100 
 
 		 295 aa  618  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  85.67 
 
 		 295 aa  532  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  61.89 
 
 		 267 aa  324  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  39.23 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  38.26 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  41.25 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  39.85 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  40 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  40.47 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  40.47 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  38.22 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  37.31 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 257 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  40.23 
 
 		 256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  35.98 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  35.23 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  35.98 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  37.69 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  37.21 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  35.61 
 
 		 261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.36 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  34.73 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  37.55 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  34.98 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  35.09 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  35.11 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  35.93 
 
 		 259 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  33.46 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  34.47 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  33.71 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  32.33 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  32.95 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  31.16 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  29.5 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  31.58 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  35.35 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  33.7 
 
 		 199 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.37 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.63 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  23.25 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  28.32 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  22.62 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  20.72 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  50 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  24.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  23.36 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.82 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.45 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  21.96 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.41 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.93 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.19 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.25 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.19 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 232 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>