54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1444 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  100 
 
 
108 aa  223  6e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1938  IS1 transposase  57.14 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1525  IS1 transposase  57.14 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0700  IS1 transposase  57.14 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0265  IS1 transposase  57.14 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.878281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0808  insertion element protein  32.95 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0740  IS1 family transposase orfA  32.95 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0735  IS1 family transposase orfA  32.95 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0667  Insertion element protein  29.41 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0449  Insertion element protein  29.41 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  39.24 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  39.24 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  39.24 
 
 
230 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  39.24 
 
 
230 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0043  IS1, transposase orfA  31.76 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0943  Insertion element protein  28.24 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0795  insertion element protein  29.41 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.531159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  48.72 
 
 
340 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4079  insertion element protein  28.24 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3317  hypothetical protein  42.59 
 
 
469 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3693  IS1 transposase  32.97 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00714444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  50 
 
 
340 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  50 
 
 
340 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  47.5 
 
 
253 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  47.5 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3201  insertion element protein  37.04 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0438746  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  47.5 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  47.5 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0724  IS1, transposase orfA  28.24 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1315  hypothetical protein  51.35 
 
 
354 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1013  putative dehydrogenase  31.88 
 
 
226 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.777049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0178  IS1, transposase orfA  27.06 
 
 
87 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00316211  hitchhiker  0.000000137018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2680  IS1 transposase  30.11 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3611  IS1 transposase  30.11 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.533589  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  47.37 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4828  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00539737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4541  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48654  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1222  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0799625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1200  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0112  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231935  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0051  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  31.76 
 
 
232 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1590  hypothetical protein  27.17 
 
 
115 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.316868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1846  hypothetical protein  27.17 
 
 
115 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.161699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>