133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1435 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 
341 aa  691  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  97.65 
 
 
341 aa  650  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  75.8 
 
 
343 aa  528  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  54.52 
 
 
349 aa  355  7e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  53.31 
 
 
349 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  57.24 
 
 
322 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  57.24 
 
 
322 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  56.9 
 
 
325 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  56.9 
 
 
325 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  59.26 
 
 
323 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  57.91 
 
 
323 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  52.68 
 
 
322 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  55.59 
 
 
324 aa  337  2e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  55.12 
 
 
323 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  56.95 
 
 
326 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  51.93 
 
 
370 aa  329  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  56.61 
 
 
326 aa  329  5e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  55.59 
 
 
344 aa  327  1e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  56.61 
 
 
321 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  56.61 
 
 
321 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  55.25 
 
 
329 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  56.61 
 
 
321 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  56.27 
 
 
321 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.93 
 
 
323 aa  322  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.25 
 
 
323 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.25 
 
 
323 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.25 
 
 
323 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.25 
 
 
323 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.25 
 
 
323 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  55.25 
 
 
323 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  55.59 
 
 
321 aa  320  2e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  54.92 
 
 
323 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.38 
 
 
317 aa  307  1e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  306  2e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  53.92 
 
 
316 aa  306  4e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  52.04 
 
 
317 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  53.29 
 
 
317 aa  303  4e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.33 
 
 
321 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  49.66 
 
 
317 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  53.98 
 
 
321 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  48.04 
 
 
323 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  48.12 
 
 
319 aa  275  1e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.15 
 
 
327 aa  273  4e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  46.53 
 
 
321 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  44.98 
 
 
321 aa  259  5e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  45.67 
 
 
322 aa  254  2e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  41.32 
 
 
341 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  45.73 
 
 
329 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  41.75 
 
 
337 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  38.94 
 
 
329 aa  234  1e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  41.42 
 
 
324 aa  234  2e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.92 
 
 
325 aa  232  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  39.71 
 
 
338 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.26 
 
 
584 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  39.39 
 
 
337 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  39.93 
 
 
322 aa  213  3e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  38.67 
 
 
320 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  39.13 
 
 
335 aa  199  8e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  38.31 
 
 
332 aa  198  1e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  38.85 
 
 
332 aa  197  2e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  39.39 
 
 
320 aa  197  2e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  33.02 
 
 
320 aa  196  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.33 
 
 
336 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  40.93 
 
 
270 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  36.95 
 
 
313 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  38.81 
 
 
319 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  36.49 
 
 
340 aa  185  1e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  37.93 
 
 
330 aa  184  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  34.04 
 
 
331 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  34.12 
 
 
333 aa  182  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.89 
 
 
329 aa  179  6e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  33.56 
 
 
331 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  34.7 
 
 
328 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30 
 
 
347 aa  164  2e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  32.43 
 
 
334 aa  163  4e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.29 
 
 
359 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  30.97 
 
 
329 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  30.14 
 
 
331 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  29.74 
 
 
327 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.05 
 
 
334 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  35.66 
 
 
298 aa  154  3e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  30.25 
 
 
328 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  32.34 
 
 
322 aa  135  1e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  29.59 
 
 
640 aa  133  4e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.74 
 
 
352 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  28.08 
 
 
355 aa  125  8e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  28.76 
 
 
320 aa  120  5e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.38 
 
 
344 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  29.39 
 
 
384 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27 
 
 
344 aa  112  7e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  27.3 
 
 
309 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  27.72 
 
 
292 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.3 
 
 
322 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.92 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  28.22 
 
 
297 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  27.49 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.09 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  23.93 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  24.91 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>