35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1381 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  100 
 
 		 363 aa  749    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  77.29 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  27.84 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  28.73 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  24.08 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  31.8 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  29.63 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  23.89 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  30 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  27.03 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  30.15 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  23.1 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  26.17 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  25.39 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  25.94 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  25.74 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  24.59 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  26.88 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  23.51 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  22.87 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  25.5 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  23.11 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  20.85 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.84 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.75 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  26.18 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  24.64 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  21.65 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  23.23 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.36 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  23.41 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  25.42 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>