More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1353 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  97.78 
 
 
225 aa  452  1e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  81.33 
 
 
225 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  66.67 
 
 
267 aa  317  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  68.78 
 
 
227 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  67.26 
 
 
230 aa  315  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.81 
 
 
230 aa  313  1e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.81 
 
 
232 aa  313  1e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  67.87 
 
 
225 aa  313  2e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  68.18 
 
 
226 aa  313  2e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  67.87 
 
 
232 aa  312  3e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.82 
 
 
230 aa  311  4e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.07 
 
 
225 aa  311  5e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.46139e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.93 
 
 
230 aa  310  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.63 
 
 
229 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.44 
 
 
225 aa  308  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.37 
 
 
230 aa  308  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  65.47 
 
 
229 aa  307  1e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  65.16 
 
 
225 aa  306  2e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.86 
 
 
231 aa  305  4e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.62 
 
 
228 aa  305  5e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.29 
 
 
224 aa  303  9e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  63.11 
 
 
225 aa  303  1e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.88 
 
 
229 aa  303  2e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  65.16 
 
 
226 aa  303  2e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.89 
 
 
228 aa  302  3e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  63.56 
 
 
227 aa  302  3e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  66.82 
 
 
230 aa  302  3e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  63.56 
 
 
245 aa  302  3e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  64.73 
 
 
225 aa  302  3e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.89 
 
 
228 aa  301  5e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  63.72 
 
 
227 aa  301  6e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  66.06 
 
 
225 aa  301  6e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  64 
 
 
228 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  65.16 
 
 
230 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  65.18 
 
 
225 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.55 
 
 
224 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.29 
 
 
228 aa  298  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  64.55 
 
 
233 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.22 
 
 
227 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  62.83 
 
 
226 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  65.62 
 
 
225 aa  295  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  62.67 
 
 
227 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  62.22 
 
 
227 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  61.09 
 
 
230 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  63.84 
 
 
227 aa  288  5e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  63.8 
 
 
231 aa  286  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.61 
 
 
227 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  63.11 
 
 
225 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.05 
 
 
225 aa  285  3e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.76 
 
 
228 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  65.26 
 
 
229 aa  284  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64 
 
 
228 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.56 
 
 
227 aa  278  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  59.09 
 
 
227 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  63.56 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.56 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  58.37 
 
 
230 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  63.64 
 
 
229 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  61.72 
 
 
226 aa  274  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  61.72 
 
 
233 aa  272  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  59.36 
 
 
223 aa  265  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  55.66 
 
 
246 aa  258  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  53.33 
 
 
257 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  52.51 
 
 
230 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  51.35 
 
 
230 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.55 
 
 
242 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.44 
 
 
255 aa  195  5e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  45.37 
 
 
267 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  46.83 
 
 
224 aa  185  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  48.65 
 
 
226 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.9 
 
 
231 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
238 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  45.74 
 
 
223 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 
221 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.52 
 
 
232 aa  172  3e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  43.11 
 
 
224 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  41.52 
 
 
221 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  39.56 
 
 
230 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  41.33 
 
 
226 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  41.36 
 
 
224 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
231 aa  164  1e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.81 
 
 
235 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  44.02 
 
 
237 aa  162  5e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  40.91 
 
 
227 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.38 
 
 
237 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 
237 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  39.29 
 
 
229 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  38.33 
 
 
232 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.46 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
231 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  39.46 
 
 
234 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  37.44 
 
 
234 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 
228 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>