35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1329 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  98.7 
 
 		 230 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 228 aa  264  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
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NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
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NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
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NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
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NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  22.49 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  22.49 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  22.27 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  23 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
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NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
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