More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1291 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
516 aa  1063    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  93.39 
 
 
514 aa  991    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.45 
 
 
508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.08 
 
 
576 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.43 
 
 
522 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.11 
 
 
413 aa  203  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.99 
 
 
555 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.09 
 
 
460 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  28.42 
 
 
475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  29.29 
 
 
526 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  30.77 
 
 
530 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  28.79 
 
 
526 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  32.3 
 
 
464 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  28.21 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  30.59 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.58 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.99 
 
 
451 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.72 
 
 
427 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.65 
 
 
454 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.35 
 
 
442 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.51 
 
 
457 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.09 
 
 
444 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.05 
 
 
459 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.73 
 
 
460 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.6 
 
 
447 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.64 
 
 
464 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.3 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  24.32 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.14 
 
 
458 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.27 
 
 
436 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.46 
 
 
408 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.02 
 
 
397 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.82 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.88 
 
 
455 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.74 
 
 
454 aa  97.8  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.43 
 
 
442 aa  97.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25 
 
 
455 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.87 
 
 
454 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.57 
 
 
407 aa  97.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.78 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.29 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.41 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.82 
 
 
448 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.14 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.39 
 
 
452 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  29.48 
 
 
529 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.39 
 
 
452 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.53 
 
 
475 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.54 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.22 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.12 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.96 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.54 
 
 
448 aa  94.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.47 
 
 
456 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.47 
 
 
456 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  24.47 
 
 
456 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.72 
 
 
452 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.72 
 
 
452 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2204  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.85 
 
 
486 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.31 
 
 
442 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.72 
 
 
452 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
451 aa  94  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.31 
 
 
449 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  27.64 
 
 
450 aa  94  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.27 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.17 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.49 
 
 
452 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.49 
 
 
452 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.83 
 
 
449 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.25 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.2 
 
 
460 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.72 
 
 
452 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.27 
 
 
388 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.64 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.72 
 
 
452 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.6 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.51 
 
 
436 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.31 
 
 
449 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.9 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.12 
 
 
457 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.63 
 
 
456 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.26 
 
 
456 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.1 
 
 
439 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.1 
 
 
449 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3152  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.88 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.782441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.63 
 
 
456 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.1 
 
 
449 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.2 
 
 
460 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.42 
 
 
476 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.93 
 
 
446 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.11 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.23 
 
 
444 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.48 
 
 
496 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.62 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.62 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.62 
 
 
460 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.49 
 
 
393 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.62 
 
 
458 aa  90.5  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.85 
 
 
445 aa  90.1  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  27.6 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>