239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1280 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  89.71 
 
 
243 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  72.29 
 
 
249 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  45.73 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  35.21 
 
 
235 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  35.38 
 
 
319 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  34.88 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  34.81 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  30.94 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.41 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  33.33 
 
 
224 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.86 
 
 
240 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  32.3 
 
 
227 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  33.82 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  31.42 
 
 
279 aa  101  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  29.05 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  28.44 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  32.34 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  33.7 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  34.34 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  33.14 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  36.41 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  33.33 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  31.71 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  30.53 
 
 
225 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  28.9 
 
 
282 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.71 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  32.75 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.95 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  32.2 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  32.26 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  32.26 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  38.84 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  32.82 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  30.84 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  30 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.84 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31.4 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  30.17 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  32.26 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  33.17 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  33.17 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  32.14 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  34.39 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13200  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.02 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.754483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  29.9 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.07 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.46 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  31.7 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.8 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.85 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000903381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  32.3 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  28.93 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  26.39 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.43 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  28.91 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  31.06 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  30.3 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  31.19 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  25.99 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  30.54 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  31.19 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  33.5 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  30.67 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.35 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  31.38 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  30.88 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  29.34 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  32.02 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  26.82 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  28.16 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  29.41 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  30.48 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  27.96 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  32.18 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  31.46 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  27.59 
 
 
267 aa  72  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  29.74 
 
 
241 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  30.06 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.08 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.15 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.77 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  26.37 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.07 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  31.1 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  26.63 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  27.27 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  28.5 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  27.62 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>