72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1218 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1218  DsrE-like protein  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725713 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1174  DsrE-like protein  83.22 
 
 		 143 aa  246  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0013044  hitchhiker  0.000454083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0977  DsrE family protein  53.03 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000957329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3247  DsrE family protein  36.5 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253566  hitchhiker  0.0000180426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00060  sulfur transfer complex subunit TusD  37 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3833  sulfur transfer complex subunit TusD  37.37 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  38.24 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0307  sulfur transfer complex subunit TusD  36 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0180937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4013  sulfur transfer complex subunit TusD  36.36 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0324388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3819  sulfur transfer complex subunit TusD  34 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000709397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1925  sulfur transfer complex subunit TusD  30.66 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4554  sulfur transfer complex subunit TusD  36.36 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178436  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3397  sulfur transfer complex subunit TusD  33.05 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.452785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3648  sulfur transfer complex subunit TusD  34 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3647  sulfur transfer complex subunit TusD  34 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000127633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3756  sulfur transfer complex subunit TusD  34 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0264721  normal  0.126397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2002  DsrE family protein  35.25 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000724121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3626  sulfur transfer complex subunit TusD  34.34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000441818  hitchhiker  0.000993351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03196  hypothetical protein  34.34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000210262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0313  sulfur transfer complex subunit TusD  34.34 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3541  sulfur transfer complex subunit TusD  34.34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.84382e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3814  sulfur transfer complex subunit TusD  34.34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  33.91 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03147  hypothetical protein  34.34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000155048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3721  sulfur transfer complex subunit TusD  34 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000063016  normal  0.0742653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0368  sulfur transfer complex subunit TusD  33.67 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0265289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3719  sulfur transfer complex subunit TusD  34.34 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0368  sulfur relay protein TusD/DsrE  33.67 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3681  sulfur transfer complex subunit TusD  35.71 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000326504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0395  sulfur transfer complex subunit TusD  32.65 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0272  sulfur transfer complex subunit TusD  35.71 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3924  sulfur transfer complex subunit TusD  35.71 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000851286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2206  DsrE family protein  31.63 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4654  sulfur transfer complex subunit TusD  33.33 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000614483  normal  0.0147781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2015  DsrE family protein  34.69 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123098  hitchhiker  0.00302042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2314  DsrE family protein  31.63 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000295076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  33.04 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3762  sulfur transfer complex subunit TusD  32.32 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000491404  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  32.58 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2200  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.61 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000731286  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2603  sulfur transfer complex subunit TusD  30.3 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2768  sulfur transfer complex subunit TusD  32.65 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30400  sulfur transfer complex subunit TusD  30.3 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0489  intracellular sulfur reduction protein DsrE  32 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.233677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002294  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  31 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2135  DsrE family protein  29.51 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293804  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2165  DsrE family protein  30.61 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000184958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3598  sulfur transfer complex subunit TusD  30.53 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3443  intracellular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  31.97 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0125489  decreased coverage  0.0000256073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2059  DsrE family protein  29.51 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0188592  hitchhiker  0.000335265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2004  DsrE family protein  29.51 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1808  DsrE-like protein  35.29 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000348316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1972  DsrE family protein  29.51 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000573125  normal  0.68852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3168  sulfur transfer complex subunit TusD  28.35 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209612  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3993  sulfur transfer complex subunit TusD  29.01 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0220527  hitchhiker  0.0053466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1840  sulfur transfer complex subunit TusD  29.01 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1781  DsrE-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111826  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2376  dsrE-related protein  30.51 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1803  DsrE family protein  28.28 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2452  DsrE-like protein  30.61 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000223621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2349  putative sulfur oxidation protein DsrE  29.41 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0286329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2377  sulfur transfer complex subunit TusD  27.21 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278614  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3338  DsrE family protein  27.56 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2110  DsrE family protein  26.23 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000251046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2474  sulfur relay protein TusD/DsrE  28.57 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000110001  hitchhiker  0.0000982729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3575  sulfur transfer complex subunit TusD  26.53 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1519  DsrE family protein  29.76 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28120  sulfur transfer complex subunit TusD  27.69 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1635  sulfur transfer complex subunit TusD  32.26 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  23.77 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1331  intracellular sulfur oxidation protein DsrE  30.59 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  22.95 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>