More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1206 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
521 aa  1081    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  91.15 
 
 
535 aa  996    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  45.97 
 
 
258 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  44.94 
 
 
256 aa  212  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 
257 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
257 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  46.09 
 
 
260 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.09 
 
 
260 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  46.09 
 
 
260 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  42.63 
 
 
258 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  43.43 
 
 
263 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  41.6 
 
 
259 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.53 
 
 
255 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  43.53 
 
 
260 aa  197  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  43.53 
 
 
260 aa  197  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  40.98 
 
 
263 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  42.34 
 
 
267 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
257 aa  183  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
249 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 
253 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
260 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
256 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
253 aa  153  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 
255 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.7 
 
 
255 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.57 
 
 
269 aa  148  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  35.68 
 
 
249 aa  146  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
255 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
254 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
255 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
263 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
253 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 
254 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.91 
 
 
254 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  32.54 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.91 
 
 
254 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.91 
 
 
254 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.91 
 
 
254 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.91 
 
 
254 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.95 
 
 
253 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
256 aa  133  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 
254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
247 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.79 
 
 
252 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
254 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.04 
 
 
254 aa  128  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
250 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
250 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.42 
 
 
274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
255 aa  127  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
249 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
250 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
250 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
250 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
249 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
265 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.95 
 
 
516 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  35.19 
 
 
259 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.72 
 
 
515 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  34.76 
 
 
259 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
252 aa  123  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  30.98 
 
 
254 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.51 
 
 
234 aa  120  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
291 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
255 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
251 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  29.79 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  29.6 
 
 
291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  28.91 
 
 
257 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  27.1 
 
 
515 aa  114  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
272 aa  114  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
280 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 
260 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
261 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
252 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
241 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  30.74 
 
 
231 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
272 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  30.27 
 
 
253 aa  107  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.13 
 
 
265 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
257 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
270 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
287 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
257 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
277 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
267 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
261 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
285 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
267 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
279 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
249 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>