87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1194 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  100 
 
 		 1068 aa  2137    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  30.03 
 
 		 1677 aa  191  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  27.22 
 
 		 998 aa  141  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.95 
 
 		 1242 aa  134  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 		 831 aa  133  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  24.12 
 
 		 816 aa  104  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.21 
 
 		 985 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.15 
 
 		 1369 aa  91.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 10429 aa  85.5  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  26.67 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 		 913 aa  80.9  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.96 
 
 		 759 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.44 
 
 		 1489 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 		 915 aa  77.4  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.84 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.29 
 
 		 1011 aa  70.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.4 
 
 		 2848 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  23.32 
 
 		 994 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 		 1011 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.62 
 
 		 926 aa  70.1  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.09 
 
 		 1769 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.36 
 
 		 3506 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  22.42 
 
 		 1550 aa  65.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  28.91 
 
 		 860 aa  65.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  24.4 
 
 		 942 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  22.89 
 
 		 1012 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  21.71 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.69 
 
 		 906 aa  60.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  21.47 
 
 		 1152 aa  61.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 1886 aa  61.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  23.43 
 
 		 986 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  22.33 
 
 		 995 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.39 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.34 
 
 		 1227 aa  59.3  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.86 
 
 		 646 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  22.64 
 
 		 991 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  23.02 
 
 		 629 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  21.3 
 
 		 939 aa  57.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 		 636 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.02 
 
 		 629 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 		 1125 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  25.55 
 
 		 2083 aa  56.2  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  27.22 
 
 		 640 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  27.86 
 
 		 684 aa  55.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  28.65 
 
 		 684 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  26.91 
 
 		 664 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  22.8 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.3 
 
 		 910 aa  54.3  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 		 407 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  25.93 
 
 		 1025 aa  54.3  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.77 
 
 		 1358 aa  53.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.56 
 
 		 972 aa  53.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.04 
 
 		 641 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  22.1 
 
 		 1001 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.48 
 
 		 2578 aa  51.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  21.88 
 
 		 1782 aa  50.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  28.21 
 
 		 640 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  21.13 
 
 		 626 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 		 1164 aa  50.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 980 aa  50.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.02 
 
 		 3152 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 1333 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  22.81 
 
 		 965 aa  49.7  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  24.88 
 
 		 488 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  37.06 
 
 		 1861 aa  48.9  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  23.03 
 
 		 909 aa  48.9  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  24 
 
 		 681 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  24 
 
 		 868 aa  48.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  50 
 
 		 4966 aa  48.1  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.06 
 
 		 2906 aa  47.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  21.57 
 
 		 1033 aa  47.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 4238 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  24.5 
 
 		 3420 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  22.99 
 
 		 995 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  21.99 
 
 		 1056 aa  47.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 		 3822 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  21.83 
 
 		 1004 aa  46.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1048 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  25.72 
 
 		 4238 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.52 
 
 		 826 aa  46.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  23.19 
 
 		 629 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  23.92 
 
 		 470 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  22.98 
 
 		 990 aa  45.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.12 
 
 		 1256 aa  45.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  57.14 
 
 		 4016 aa  45.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  23.15 
 
 		 677 aa  45.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1881 aa  45.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>