More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1075 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  93.46 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  56.63 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  43.21 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  51.47 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  42.35 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  51.47 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.57 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.05 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  38.27 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.05 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.05 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  38.37 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  34.09 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  33.64 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1872  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.5 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  34.09 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  37.8 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.18 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 349 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  34.09 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  37.04 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 348 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 328 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 312 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  44.78 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>