25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1002 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  100 
 
 		 505 aa  1045    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  27.57 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  24.19 
 
 		 496 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  23.58 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  24.88 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  31.36 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  23.87 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  24.26 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  24.32 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  23.39 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  19.57 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  24.91 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  24.91 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  23.84 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  22.74 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  23.08 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  23.08 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  22.5 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  23.08 
 
 		 533 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  22.42 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  25.09 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  26 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  26 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  29.37 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  28.93 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>