118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0945 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  91.58 
 
 
273 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  67.78 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  77.93 
 
 
344 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  35.09 
 
 
230 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  35.96 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  35.53 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  35.53 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  35.53 
 
 
234 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  36 
 
 
230 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  36.48 
 
 
230 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  35.27 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  32.33 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  34.06 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  34.36 
 
 
230 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  33.92 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  33.92 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  34.43 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  33.92 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  33.92 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  33.63 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  33.92 
 
 
230 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  36.09 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  34.67 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  33.63 
 
 
230 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  38.31 
 
 
226 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  42.37 
 
 
249 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  34.43 
 
 
225 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  38.22 
 
 
227 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  32.51 
 
 
224 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  37.17 
 
 
227 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  35.75 
 
 
220 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  37.37 
 
 
225 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  36.22 
 
 
224 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  37.63 
 
 
289 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  40.68 
 
 
227 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  35.35 
 
 
219 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  31.82 
 
 
231 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  34.44 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  32.57 
 
 
249 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  40.96 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  33.97 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  31.5 
 
 
239 aa  95.9  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  41.76 
 
 
227 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3828  hypothetical protein  40.12 
 
 
227 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  38.33 
 
 
223 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  32.71 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  30.24 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  33.94 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  32.32 
 
 
186 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  31.16 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4263  hypothetical protein  34.16 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88561  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  30.63 
 
 
224 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3581  hypothetical protein  34.65 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  29.59 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  33.81 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  31.39 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  32.16 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0720  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0477616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  32.54 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  34 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  31.19 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  31.53 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  29.77 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  36.84 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  32.99 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  31.91 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  32.93 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  32.27 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  27.73 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1605  hypothetical protein  33.86 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  0.0122342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  35.89 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  29.95 
 
 
621 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  30.89 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  29.17 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  34.36 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  35.89 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  27.06 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  29.89 
 
 
409 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  29.12 
 
 
220 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  32.28 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  34.39 
 
 
393 aa  62  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  32.24 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  25.25 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  31.39 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  31.53 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  32.64 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  29.06 
 
 
423 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  25.42 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>