128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0879 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  100 
 
 		 330 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  72.09 
 
 		 336 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  55.62 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  57.14 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  43.77 
 
 		 332 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  46.27 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  45.68 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42.11 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  40.74 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  40.74 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  39.51 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  35.84 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  56.21 
 
 		 198 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  35.51 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  35.51 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  74.47 
 
 		 121 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 197 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  47.73 
 
 		 141 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  94.44 
 
 		 73 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  37.57 
 
 		 192 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  38.55 
 
 		 210 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  48.33 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 186 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  43.28 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  43.9 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  40.77 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  41.8 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  47.9 
 
 		 126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  43.09 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  41.46 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  38.02 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  38.4 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  45.22 
 
 		 127 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  39.39 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  44.83 
 
 		 120 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  39.53 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  37.6 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  38.98 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  37.19 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  41.53 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  38.14 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  38.93 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  37.9 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  34.07 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  34.11 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  38.33 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  35.54 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  31.36 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  33.59 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  32.84 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  34.71 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  38.14 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  35.54 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  35.16 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  41.23 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  34.65 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  34.65 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  35.54 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  29.01 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  33.88 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  34.17 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  35.25 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  33.05 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  32.28 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  35.07 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  31.3 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  31.4 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  33.93 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  33.93 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  36.15 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  27.6 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  33.05 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  30.95 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  33.04 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  29.93 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  33.04 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  34.48 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  29.73 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  29.46 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  32.79 
 
 		 135 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  33.04 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  30.36 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  30.36 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  47.89 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  49.15 
 
 		 77 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  38.16 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  42.42 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  50.88 
 
 		 130 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  38.1 
 
 		 126 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  44.83 
 
 		 129 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  48.28 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  42.42 
 
 		 127 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  39.24 
 
 		 127 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  43.1 
 
 		 102 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  40.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>