32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0827 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0827  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.098665  decreased coverage  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0849  hypothetical protein  97.46 
 
 
118 aa  237  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.506643  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0878  hypothetical protein  72.55 
 
 
110 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206731  hitchhiker  0.000000513036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1572  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120004  normal  0.637459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2053  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0593615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3688  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2411  hypothetical protein  38.04 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.850789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0857  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3165  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3266  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2958  hypothetical protein  38.37 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.4749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2996  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3699.1  hypothetical protein  36.05 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3317  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3691  hypothetical protein  37.97 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3656  hypothetical protein  39.24 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0975  hypothetical protein  37.97 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0539485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0963  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3223  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00463747  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3131  hypothetical protein  37.97 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00959511  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0891  hypothetical protein  37.97 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1032  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0122538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1065  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000960688  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3327  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224467  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3075  hypothetical protein  36.71 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3093  hypothetical protein  35.23 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2832  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0152708  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3990  hypothetical protein  32.91 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189568  normal  0.364321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0175  hypothetical protein  32.53 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3297  hypothetical protein  24.44 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.23288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2724  hypothetical protein  32.43 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18170  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>