123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0788 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  91.7 
 
 		 265 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  42.91 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  36.36 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  31.47 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  30.41 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  28.69 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  34.36 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  31.54 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  32.09 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  35.79 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  36.36 
 
 		 453 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  36.17 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  36.17 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  36.17 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  34.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  36.89 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.67 
 
 		 420 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  36.17 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  23.51 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  37.63 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.9 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0273  Abortive infection protein  33.93 
 
 		 166 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  34.69 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  34.69 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  25.74 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.78 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  26.95 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  31.87 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  31.91 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  26.29 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  33.88 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  29.63 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.28 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  28.28 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  27.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  34.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  34.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  34.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  32.58 
 
 		 420 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  28.12 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  36.54 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  31 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  29.89 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  30.52 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.21 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  33.66 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  28.28 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  33.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  29 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2703  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  22.61 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  27.35 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2902  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  32.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  28.85 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  27.43 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  32.08 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  37.35 
 
 		 453 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  30.39 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  26.85 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  34.41 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 538 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  27.1 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  29.2 
 
 		 453 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  26.35 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  31.07 
 
 		 602 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  37.17 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32 
 
 		 480 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07541  membrane-associated protease  32.76 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  28.42 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  32.61 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  27.59 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  24.71 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  33.33 
 
 		 452 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>