299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0771 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  99.23 
 
 
259 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  75.57 
 
 
256 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  59.15 
 
 
232 aa  281  6e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  57.08 
 
 
226 aa  273  2e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  56.22 
 
 
244 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  57.87 
 
 
225 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  56.65 
 
 
224 aa  261  7e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  56.41 
 
 
228 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  55.74 
 
 
223 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  55.79 
 
 
224 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  55.56 
 
 
228 aa  254  1e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  54.36 
 
 
230 aa  253  2e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  54.47 
 
 
228 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  54.08 
 
 
224 aa  253  2e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  54.27 
 
 
224 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  54.7 
 
 
224 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  54.27 
 
 
224 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  51.88 
 
 
227 aa  252  5e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  54.27 
 
 
229 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  53.11 
 
 
229 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  55.79 
 
 
224 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  52.12 
 
 
226 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  53.94 
 
 
233 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  55.36 
 
 
228 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  52.54 
 
 
226 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  54.7 
 
 
229 aa  245  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  52.14 
 
 
225 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  52.14 
 
 
224 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  52.79 
 
 
224 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  55.32 
 
 
232 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  55.42 
 
 
237 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  52.34 
 
 
224 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  53.19 
 
 
225 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  56.33 
 
 
236 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  52.74 
 
 
227 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  52.77 
 
 
225 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  56.71 
 
 
224 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  54.27 
 
 
228 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  53.22 
 
 
221 aa  238  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  53.85 
 
 
241 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  54.89 
 
 
230 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  53.19 
 
 
226 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  53.02 
 
 
229 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  53.02 
 
 
229 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  55.56 
 
 
229 aa  234  1e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  53.19 
 
 
237 aa  234  1e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  51.28 
 
 
234 aa  234  1e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  54.27 
 
 
224 aa  233  2e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  51.91 
 
 
234 aa  233  2e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  53.65 
 
 
224 aa  231  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  52.97 
 
 
246 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  51.49 
 
 
234 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  52.56 
 
 
223 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  51.67 
 
 
235 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  51.49 
 
 
234 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  48.37 
 
 
244 aa  226  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  51.06 
 
 
230 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  51.06 
 
 
230 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  49.79 
 
 
228 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  50.64 
 
 
237 aa  222  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  48.72 
 
 
233 aa  221  1e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  50.64 
 
 
233 aa  220  2e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  48.54 
 
 
230 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  49.34 
 
 
222 aa  214  1e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  48.29 
 
 
227 aa  213  3e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  48.48 
 
 
233 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  49.36 
 
 
222 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  47.41 
 
 
224 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  48.71 
 
 
227 aa  200  2e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  48.09 
 
 
229 aa  200  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  44.12 
 
 
227 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  45.41 
 
 
226 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  44.35 
 
 
225 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  43.91 
 
 
225 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  42.92 
 
 
229 aa  189  3e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  44.64 
 
 
224 aa  189  3e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  43.67 
 
 
229 aa  189  6e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  42.86 
 
 
229 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  43.81 
 
 
224 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  43.81 
 
 
224 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  43.23 
 
 
226 aa  185  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  41.48 
 
 
225 aa  184  1e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  41.59 
 
 
225 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  42.22 
 
 
230 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  41.92 
 
 
224 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  44.89 
 
 
231 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  36.72 
 
 
484 aa  169  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  43.88 
 
 
221 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  39.37 
 
 
251 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  39.47 
 
 
222 aa  164  2e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  39.47 
 
 
222 aa  164  2e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  40 
 
 
243 aa  164  2e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  48.17 
 
 
208 aa  164  2e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  39.91 
 
 
223 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  38.86 
 
 
224 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  40.43 
 
 
226 aa  158  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  39.41 
 
 
222 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  41.48 
 
 
223 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  41.6 
 
 
220 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>