More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0743 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  100 
 
 
187 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  88.2 
 
 
178 aa  333  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  75.42 
 
 
188 aa  291  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  67.57 
 
 
164 aa  221  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  65.54 
 
 
166 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  65.54 
 
 
166 aa  214  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  65.54 
 
 
167 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  65.54 
 
 
167 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  63.09 
 
 
169 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  63.51 
 
 
168 aa  208  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  62 
 
 
171 aa  208  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  62.84 
 
 
161 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  62.16 
 
 
168 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  63.33 
 
 
160 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  63.33 
 
 
188 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  63.09 
 
 
168 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  63.51 
 
 
161 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  58.9 
 
 
163 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  67.91 
 
 
161 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  69.4 
 
 
161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  62.59 
 
 
162 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  68.66 
 
 
160 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  73.33 
 
 
161 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  62.5 
 
 
166 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  64 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  68.66 
 
 
161 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  61.81 
 
 
166 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  66.42 
 
 
178 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  60.96 
 
 
167 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  62.76 
 
 
162 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  59.46 
 
 
167 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  75.44 
 
 
161 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  75.44 
 
 
161 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  68.99 
 
 
180 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  70.83 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  71.55 
 
 
153 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  63.58 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  66.95 
 
 
180 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  55.56 
 
 
146 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  55.19 
 
 
173 aa  175  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  66.15 
 
 
176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  64.39 
 
 
179 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  54.74 
 
 
187 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  48.37 
 
 
185 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
169 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  54.81 
 
 
180 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  49.3 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  47.47 
 
 
185 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
189 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  48.48 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  46.97 
 
 
158 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 
248 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 
175 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  41.41 
 
 
168 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.98 
 
 
159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
168 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
159 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
159 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.42 
 
 
159 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  35.67 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
159 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
159 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
159 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
159 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  44.63 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
159 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  39.87 
 
 
167 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
170 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
155 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  40.34 
 
 
161 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
166 aa  104  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
327 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  38.81 
 
 
161 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 
161 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
158 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 
173 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.83 
 
 
160 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  41.38 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  41.38 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  42.64 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>