More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0736 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  100 
 
 		 244 aa  507  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  95.9 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  80 
 
 		 245 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  58.67 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  59.38 
 
 		 215 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  56.22 
 
 		 226 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  56 
 
 		 215 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  54.67 
 
 		 215 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  55.51 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  54.22 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  54.67 
 
 		 215 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  54.22 
 
 		 215 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  54.22 
 
 		 215 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  53.22 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  54.02 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  51.56 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  54.02 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  50.88 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  50.22 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  53.62 
 
 		 193 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  50.67 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  50 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  47.77 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  52 
 
 		 216 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 213 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  51.11 
 
 		 213 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  49.78 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  50.21 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  51.56 
 
 		 213 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  48.72 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  51.56 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  49.55 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  49.56 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  49.56 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.92 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 		 212 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  43.44 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  44.3 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  40 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  40.69 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 223 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  36.73 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  41.1 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  38.5 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  38.96 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 223 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.27 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.04 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 225 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 274 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  42.45 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  29.73 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.04 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.52 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.8 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  40.87 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  40.54 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  25.99 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  42.16 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.94 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  38.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.4 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.22 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  25.82 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  25.23 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>