More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0577 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 961 aa  1963    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  30.33 
 
 		 900 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3106  pentapeptide repeat protein  24.14 
 
 		 978 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  26.05 
 
 		 971 aa  181  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1033 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1478  pentapeptide repeat-containing protein  28.91 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 		 973 aa  95.9  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  28.62 
 
 		 295 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 489 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 		 567 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 710 aa  87.8  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  23.46 
 
 		 903 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.65 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.47 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.75 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.37 
 
 		 213 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 		 266 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  27.42 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.85 
 
 		 294 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 		 214 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.72 
 
 		 734 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.12 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.43 
 
 		 320 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 215 aa  77.4  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.18 
 
 		 245 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 332 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 205 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 190 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.62 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.5 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.9 
 
 		 600 aa  74.3  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 		 157 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  32.52 
 
 		 315 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 		 225 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 		 319 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 184 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 311 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  27.43 
 
 		 250 aa  73.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  43.36 
 
 		 267 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 		 340 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 448 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.86 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  34.38 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.86 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  34.38 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.56 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 727 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 215 aa  72  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.22 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  38.98 
 
 		 168 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 268 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 		 175 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  26.53 
 
 		 260 aa  70.5  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 		 180 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 		 174 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  28.9 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 416 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 348 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 		 260 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 		 315 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.76 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 264 aa  69.7  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  30.2 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 		 862 aa  69.3  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 		 877 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  31.5 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  31.5 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  27.63 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  34.68 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>