More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0573 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  100 
 
 
455 aa  909  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  1.23833e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  93.89 
 
 
456 aa  777  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  67.1 
 
 
464 aa  551  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  9.06287e-10 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  41.71 
 
 
405 aa  282  8e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  42 
 
 
409 aa  279  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.85815e-06  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.82 
 
 
410 aa  275  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  40.94 
 
 
416 aa  274  2e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.87508e-07  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  40.94 
 
 
416 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.42362e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  40.94 
 
 
416 aa  273  5e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.94 
 
 
410 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.9827e-08  hitchhiker  2.36896e-09 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  38.55 
 
 
397 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 
416 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.24755e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  38.19 
 
 
397 aa  263  7e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  38.19 
 
 
397 aa  263  7e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  38.19 
 
 
397 aa  263  7e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 
393 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 
401 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  37.67 
 
 
401 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.26253e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  37.67 
 
 
401 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.30358e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 
399 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  38.22 
 
 
405 aa  255  1e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  36.85 
 
 
399 aa  254  2e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  37.67 
 
 
435 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  37.67 
 
 
428 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  38.3 
 
 
385 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  39.49 
 
 
420 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.46 
 
 
398 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  37.3 
 
 
405 aa  244  2e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  36.88 
 
 
372 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  36.88 
 
 
372 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  37.97 
 
 
404 aa  239  6e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  36.65 
 
 
372 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  35.97 
 
 
372 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  35.4 
 
 
408 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  35.4 
 
 
408 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  36.08 
 
 
399 aa  235  1e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  36.43 
 
 
372 aa  235  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  35.29 
 
 
383 aa  234  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.1 
 
 
387 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  35.37 
 
 
371 aa  232  8e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  35.37 
 
 
371 aa  232  8e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  35.37 
 
 
371 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  35.37 
 
 
371 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  35.37 
 
 
371 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  35.37 
 
 
371 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  35.37 
 
 
371 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.39116e-09  normal  0.0134871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 
371 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  35.15 
 
 
371 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  33.18 
 
 
415 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  36.32 
 
 
399 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  37.04 
 
 
370 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  37.04 
 
 
370 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  36.81 
 
 
370 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  34.42 
 
 
394 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  36.41 
 
 
430 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 
428 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 
396 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 
406 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 
401 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 
406 aa  220  4e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  36.6 
 
 
382 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 
393 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  35.34 
 
 
371 aa  217  3e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  35.19 
 
 
389 aa  218  3e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  34.04 
 
 
414 aa  215  1e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
444 aa  214  3e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  35.78 
 
 
348 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  34.45 
 
 
384 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.58 
 
 
397 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.82 
 
 
438 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  32.02 
 
 
397 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  32.93 
 
 
402 aa  205  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  31.21 
 
 
390 aa  202  1e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  33.8 
 
 
377 aa  201  2e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  33.11 
 
 
414 aa  200  4e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.09 
 
 
396 aa  198  2e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 
387 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  32.73 
 
 
390 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  33.94 
 
 
394 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  32.24 
 
 
390 aa  188  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  35.2 
 
 
569 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.68 
 
 
393 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  31.76 
 
 
390 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 
394 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 
410 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 
445 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  31.16 
 
 
391 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 
407 aa  173  6e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.78 
 
 
392 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  28.29 
 
 
390 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 
409 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 
390 aa  166  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 
401 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  28.03 
 
 
391 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  27.8 
 
 
391 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 
416 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
448 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
442 aa  142  1e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  32.79 
 
 
403 aa  140  4e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 
402 aa  140  5e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>