84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0518 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  86.29 
 
 		 197 aa  358  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  46.31 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  33.14 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  29.55 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  29.51 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  37.1 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  26.97 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  32.34 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000120656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  31.48 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  25.52 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  25.52 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  29.7 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  32.7 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  35.45 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  33.06 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  27.03 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  29.09 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  28.49 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  28.89 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  33.07 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  32 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  24.16 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  25.84 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  37.72 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  25.84 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  33.64 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  31.71 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  36 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  35.25 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722055  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  26.78 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000825555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  23.76 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  24.44 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  30.34 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  30.92 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  25.84 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  35.14 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  25.28 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  25.28 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  24.16 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  24.72 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  25.7 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  27.14 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  24.44 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  24.44 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  24.72 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  34.21 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  24.72 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  29.84 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  28.49 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  31.86 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  28.07 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  30.82 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  32.2 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  25.68 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  27.12 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  32.12 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  26.44 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  36.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  25.7 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  34.51 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  26.19 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  24.86 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>