58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0462 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  100 
 
 		 248 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  34.64 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  30.6 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  31.17 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  32.26 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  32.26 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  35.21 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  33.33 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  27.72 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  24.61 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  28.38 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  26.4 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  32.64 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  30.52 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  26.4 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  34.51 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  29.82 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  28.57 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  29.17 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  28.17 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  25.53 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  26.75 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  29.45 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  26.25 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  27.97 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  27.67 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  30.2 
 
 		 177 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  27.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  30.2 
 
 		 177 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  27.39 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  29.63 
 
 		 159 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  27.33 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  27.16 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  26.75 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  28.17 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  26.53 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  27.88 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  29.17 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  34.15 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  26.79 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  34.13 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  26.32 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  29.58 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  23.6 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  29.05 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  23.03 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  27.03 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  28.57 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  29.55 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  34.45 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  25.47 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  34.45 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  34.12 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  28.37 
 
 		 526 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  28.37 
 
 		 526 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  28.37 
 
 		 526 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>