More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0433 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
278 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  95.22 
 
 
272 aa  532  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  74.82 
 
 
275 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  51.85 
 
 
271 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  51.91 
 
 
268 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  50.92 
 
 
271 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  51.46 
 
 
274 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  51.29 
 
 
266 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  54.2 
 
 
277 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  52.38 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  50.55 
 
 
276 aa  268  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  51.67 
 
 
268 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  49.63 
 
 
272 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  49.08 
 
 
265 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  50.42 
 
 
279 aa  262  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  53.33 
 
 
273 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  47.6 
 
 
267 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  48.91 
 
 
270 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  50.92 
 
 
265 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  47.97 
 
 
265 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  47.65 
 
 
271 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  48.35 
 
 
273 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
265 aa  255  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  47.23 
 
 
265 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
265 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  47.06 
 
 
272 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 
272 aa  248  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 
271 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  46.89 
 
 
268 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.72 
 
 
272 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 
271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 
271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 
271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  48.21 
 
 
272 aa  245  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  45.09 
 
 
270 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  46.4 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  48.21 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  49.45 
 
 
269 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  50.41 
 
 
285 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  48.53 
 
 
271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  48.03 
 
 
273 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 
269 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 
268 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 
268 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 
271 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  49.59 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  49.19 
 
 
269 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  51.26 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  47.04 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  45.49 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  47.04 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  44.75 
 
 
281 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  46.46 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  46.46 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.24 
 
 
277 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 
279 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
278 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 
278 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  46.9 
 
 
279 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  48.34 
 
 
272 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 
278 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
278 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 
279 aa  225  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 
279 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 
279 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  45.97 
 
 
278 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 
278 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  43.19 
 
 
279 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  48.73 
 
 
278 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  46.44 
 
 
280 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  46.28 
 
 
263 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  46.13 
 
 
268 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  46.03 
 
 
280 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  45.08 
 
 
278 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.12 
 
 
264 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  45 
 
 
279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.64 
 
 
270 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 
268 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  45.87 
 
 
263 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 
269 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 
267 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.32 
 
 
267 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 
268 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 
271 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>