159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0254 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  87.02 
 
 
285 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  61.19 
 
 
277 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.73 
 
 
247 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.17 
 
 
247 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37 
 
 
260 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.23 
 
 
246 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  37.5 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.44 
 
 
242 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  38.57 
 
 
243 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.44 
 
 
242 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  35.93 
 
 
244 aa  152  6e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.81 
 
 
241 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.9 
 
 
254 aa  140  2e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  34.96 
 
 
244 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.21 
 
 
237 aa  139  5e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  36 
 
 
241 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
264 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  37.93 
 
 
263 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.15 
 
 
264 aa  134  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.2 
 
 
210 aa  132  4e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.11 
 
 
238 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  40.91 
 
 
265 aa  130  2e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.23 
 
 
236 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.32 
 
 
242 aa  129  4e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.23 
 
 
236 aa  129  5e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.23 
 
 
236 aa  129  5e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.6 
 
 
242 aa  128  9e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.22 
 
 
237 aa  128  9e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.8 
 
 
236 aa  127  2e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.42 
 
 
237 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.42 
 
 
237 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.42 
 
 
237 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.42 
 
 
237 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.76 
 
 
239 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.93 
 
 
237 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  40.78 
 
 
258 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  32.18 
 
 
262 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  36.65 
 
 
238 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.98401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.53 
 
 
245 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.36 
 
 
238 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  37.79 
 
 
262 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  35.29 
 
 
272 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.85 
 
 
251 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  34.47 
 
 
245 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.43 
 
 
238 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.51 
 
 
238 aa  121  1e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.18 
 
 
238 aa  120  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.18 
 
 
238 aa  120  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.18 
 
 
238 aa  120  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  31.44 
 
 
232 aa  119  5e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.1 
 
 
251 aa  119  8e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 
241 aa  118  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.4 
 
 
242 aa  118  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.86403e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 
241 aa  118  1e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 
241 aa  118  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.13 
 
 
262 aa  117  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.18 
 
 
245 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.36 
 
 
241 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.36 
 
 
241 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.36 
 
 
241 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.36 
 
 
241 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.7 
 
 
241 aa  115  9e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  30.74 
 
 
347 aa  115  1e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.06 
 
 
241 aa  114  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.09 
 
 
245 aa  114  2e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.7 
 
 
242 aa  114  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.31 
 
 
250 aa  114  2e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.87 
 
 
241 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.16 
 
 
261 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  30.74 
 
 
361 aa  112  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.06 
 
 
241 aa  108  9e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  36.76 
 
 
178 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32 
 
 
240 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  99  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.03453e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
179 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  37.1 
 
 
187 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.37 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  30.8 
 
 
242 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  28.32 
 
 
239 aa  83.2  4e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  33.14 
 
 
246 aa  80.9  2e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.61 
 
 
236 aa  81.3  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.56 
 
 
240 aa  77.8  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  28.3 
 
 
248 aa  76.3  5e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.32 
 
 
241 aa  74.7  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  33.08 
 
 
281 aa  74.3  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.39 
 
 
242 aa  70.9  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.39 
 
 
242 aa  70.1  4e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  27.48 
 
 
241 aa  70.1  4e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  28.88 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.95 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.95 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.95 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  28.7 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>