129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0243 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  373  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  52.15 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  50.31 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  47.31 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  43.27 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  46.78 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  48.39 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  44.64 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  46.39 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  48.48 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  45.71 
 
 		 177 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  46.11 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  44.58 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  40.23 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  48.28 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  43.11 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  41.9 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  39.18 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  39.53 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  40.24 
 
 		 163 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  40.83 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  40.12 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  40.83 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  40.57 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  40.83 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  39.43 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  38.82 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  37.64 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  36.59 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  35.88 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  35.88 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  34.15 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  26.71 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.95 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.95 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.36 
 
 		 1372 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25.97 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  65.71 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.66 
 
 		 1345 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  65.71 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.18 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  29.22 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  26.49 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  31.73 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  28.31 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  26.01 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  27.48 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  26.55 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  28.95 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  27.5 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  27.42 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  30.91 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  21.12 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.06 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  24.55 
 
 		 249 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  33.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  27.93 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  26.89 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.36 
 
 		 314 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  23.73 
 
 		 240 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  25.93 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  25.58 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  25 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  25.2 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  25.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  26.01 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  22.93 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.6 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  25.66 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  21.64 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  21.26 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  23.58 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  23.23 
 
 		 323 aa  44.7  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  23.14 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  24.14 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  23.3 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>