85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0226 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  84.34 
 
 		 498 aa  850    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  100 
 
 		 498 aa  1032    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  47.53 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  41.15 
 
 		 691 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  42.17 
 
 		 685 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.79 
 
 		 685 aa  289  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  41.15 
 
 		 678 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  31.72 
 
 		 851 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  38.89 
 
 		 587 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.61 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.91 
 
 		 822 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  38.84 
 
 		 700 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  42.78 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  46.84 
 
 		 603 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  38.97 
 
 		 900 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  45.62 
 
 		 834 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  30.48 
 
 		 705 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30.23 
 
 		 666 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  40.54 
 
 		 517 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  36.14 
 
 		 862 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  39.9 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.56 
 
 		 754 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.73 
 
 		 723 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.69 
 
 		 683 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  46.9 
 
 		 598 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  33.46 
 
 		 999 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  38.89 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  38.89 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  34.16 
 
 		 696 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  39.71 
 
 		 805 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.79 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.28 
 
 		 732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.24 
 
 		 765 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  36.84 
 
 		 845 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.08 
 
 		 722 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  36.45 
 
 		 687 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  43.62 
 
 		 605 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  33.47 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.22 
 
 		 421 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  35.53 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.16 
 
 		 502 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.16 
 
 		 568 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  33.2 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  33.2 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  38.71 
 
 		 629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  30.49 
 
 		 810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.19 
 
 		 698 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.96 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  33.49 
 
 		 734 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  35.76 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  31.84 
 
 		 853 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.58 
 
 		 729 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.82 
 
 		 743 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.98 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  37.74 
 
 		 743 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  38.57 
 
 		 899 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 590 aa  97.1  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  28.91 
 
 		 571 aa  93.6  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  31.18 
 
 		 352 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  28.64 
 
 		 638 aa  92  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  30.73 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  32.83 
 
 		 781 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  35.62 
 
 		 303 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.95 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.65 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  29.65 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28.95 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  25.62 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.96 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.67 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.86 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  23.58 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.2 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.82 
 
 		 748 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.37 
 
 		 410 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 651 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  36.46 
 
 		 578 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.64 
 
 		 530 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  28.1 
 
 		 803 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.74 
 
 		 578 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  29.46 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  28.38 
 
 		 668 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.93 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.43 
 
 		 679 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.76 
 
 		 914 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>