247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0208 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0228  SirA-like  85.16 
 
 		 161 aa  266  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000086936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  55.56 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  52.08 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  54.17 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  54.17 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  50 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  50 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  52.08 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  52.08 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  45.76 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  45.76 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  50 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  50 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  48.08 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  47.92 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  50 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  42.31 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  42.31 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  36.78 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  48.08 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  39.19 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.03 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  50 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  39.19 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  47.06 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  54.9 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.31 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  47.92 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  48.08 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  48.08 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  47.92 
 
 		 75 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.76 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  46.15 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  48.08 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  50 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  48.08 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  37.84 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  42 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  41.67 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.67 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  50 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  44.23 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  41.67 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  46.15 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  45.83 
 
 		 76 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  48.94 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  47.92 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  47.83 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.22 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  44.23 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  42 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  42.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  45.1 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  44 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  25.96 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  45.1 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  45.1 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  38.18 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  45.1 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  45.83 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  47.83 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  43.75 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  42.31 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  37.29 
 
 		 76 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  38.98 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  36.73 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  36.73 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  36.73 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>