23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0205 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0205  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  100 
 
 		 66 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000222136  decreased coverage  0.0000121699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0225  thiamine biosynthesis protein ThiS  98.48 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00707568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0354  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370905  hitchhiker  0.000392774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.34 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.34 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.78 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.38 
 
 		 331 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.07 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.31 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.51 
 
 		 65 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>