More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0197 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  100 
 
 
410 aa  843    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  94.15 
 
 
410 aa  802    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  72.36 
 
 
400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  51.67 
 
 
395 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  51.67 
 
 
394 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  51.67 
 
 
394 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  53.73 
 
 
394 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  52.93 
 
 
399 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  48.37 
 
 
399 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  49.36 
 
 
399 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  48.21 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  48.87 
 
 
398 aa  356  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  49.11 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  49.11 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  48.6 
 
 
399 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  49.36 
 
 
400 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  48.98 
 
 
398 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  49.49 
 
 
399 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  48.97 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  48.98 
 
 
399 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  48.98 
 
 
399 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  48.98 
 
 
399 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  48.98 
 
 
399 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  48.59 
 
 
404 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  47.47 
 
 
398 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  46.56 
 
 
397 aa  347  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  50.13 
 
 
395 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.94 
 
 
395 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.22 
 
 
398 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.48 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  47.97 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  47.59 
 
 
411 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  47.3 
 
 
400 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.27 
 
 
399 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.46 
 
 
403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.46 
 
 
403 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  46.21 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  44.84 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  47.09 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  46.51 
 
 
398 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.2 
 
 
399 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  44.76 
 
 
399 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  46.9 
 
 
409 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  47.44 
 
 
397 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  47.42 
 
 
425 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  43.99 
 
 
401 aa  332  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.1 
 
 
408 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  44.78 
 
 
402 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45.34 
 
 
405 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  47.16 
 
 
425 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  43.65 
 
 
396 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  43.65 
 
 
396 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  43.54 
 
 
398 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  43.54 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  43.65 
 
 
396 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  46.33 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.33 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  46.13 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  43.48 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  44.22 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  46.56 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  43.88 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.08 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  43.22 
 
 
403 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  45.29 
 
 
398 aa  325  7e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.93 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.88 
 
 
397 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  46.04 
 
 
421 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.42 
 
 
402 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  43.26 
 
 
397 aa  322  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.96 
 
 
397 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  48.1 
 
 
449 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  44.76 
 
 
411 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.53 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  41.69 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  46.68 
 
 
397 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  42.89 
 
 
397 aa  319  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.45 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  43.15 
 
 
398 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  44.22 
 
 
399 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  42.86 
 
 
401 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  47.15 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  43.59 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  42.67 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  44.56 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  41.27 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  45.32 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  43.5 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  44.19 
 
 
398 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  42.32 
 
 
421 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  42.64 
 
 
400 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  42.64 
 
 
400 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  42.46 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  47.21 
 
 
414 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  47.21 
 
 
414 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>