29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0188 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  51.06 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  39.38 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  38.32 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  46.53 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  36 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  40.54 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  33.94 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  31.85 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  31.85 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  36.91 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  30.93 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  30.93 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.49 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  27.81 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  32.5 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  28.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 		 229 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  23.57 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  27.16 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  30.49 
 
 		 255 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  25.4 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2018  hypothetical protein  23.77 
 
 		 196 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  34.43 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>