More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0145 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  91.56 
 
 
225 aa  424  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  68.14 
 
 
208 aa  278  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.76 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.26 
 
 
217 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.76 
 
 
214 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50 
 
 
210 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.01 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.2 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  48.02 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.98 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.28 
 
 
210 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.89 
 
 
212 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  47.5 
 
 
210 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.94 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  43.06 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.71 
 
 
209 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.5 
 
 
210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.33 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.83 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.43 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  42.33 
 
 
226 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.87 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.39 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.39 
 
 
223 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.58 
 
 
206 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  44.08 
 
 
217 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  44.08 
 
 
217 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.44 
 
 
208 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.58 
 
 
219 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.19 
 
 
211 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  41.23 
 
 
225 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  41.63 
 
 
212 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.5 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  45.24 
 
 
230 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  44.98 
 
 
210 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  41.15 
 
 
212 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  42.72 
 
 
226 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.4 
 
 
219 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  41.74 
 
 
260 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.41 
 
 
208 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  41.9 
 
 
230 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.88 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  44.02 
 
 
215 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.06 
 
 
210 aa  151  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  44.62 
 
 
203 aa  149  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43 
 
 
204 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.5 
 
 
207 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  39.32 
 
 
203 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  40.64 
 
 
244 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.81 
 
 
225 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  46.23 
 
 
210 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  42.45 
 
 
215 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  43.72 
 
 
204 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.79 
 
 
213 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.22 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  43.43 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  45.16 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.04 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  41.23 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  42.18 
 
 
230 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  46.41 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.36 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  40.38 
 
 
218 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.18 
 
 
210 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  42.11 
 
 
212 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.53 
 
 
203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  41.83 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  41.26 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  45.1 
 
 
226 aa  144  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.71 
 
 
207 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  38.79 
 
 
216 aa  144  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.87 
 
 
225 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  41.38 
 
 
234 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  41.63 
 
 
212 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  41.15 
 
 
214 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  38.32 
 
 
217 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.35 
 
 
206 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.94 
 
 
207 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  42.99 
 
 
252 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  40 
 
 
212 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  43.06 
 
 
208 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  35.92 
 
 
209 aa  141  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.72 
 
 
206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.72 
 
 
206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.72 
 
 
206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40.89 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  42.36 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.48 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  42.79 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  40.38 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.46 
 
 
901 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.29 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  43.78 
 
 
205 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.5 
 
 
215 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.04 
 
 
226 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  42.57 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>