More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0097 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  69.63 
 
 
428 aa  637  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  100 
 
 
426 aa  889  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  70.23 
 
 
429 aa  637  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  70.23 
 
 
429 aa  637  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  70.47 
 
 
429 aa  641  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  86.15 
 
 
426 aa  783  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  97.89 
 
 
426 aa  872  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  69.86 
 
 
428 aa  637  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  70.23 
 
 
429 aa  637  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.86 
 
 
427 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  69.07 
 
 
429 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  70.14 
 
 
436 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  69.77 
 
 
429 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  69.07 
 
 
429 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  67.44 
 
 
429 aa  617  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  67.67 
 
 
429 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  66.67 
 
 
431 aa  614  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  66.05 
 
 
429 aa  605  1e-172  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  67.45 
 
 
427 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  65.96 
 
 
428 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  1.71793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  66.51 
 
 
424 aa  591  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  65.03 
 
 
431 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  64.8 
 
 
428 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.89188e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  65.09 
 
 
432 aa  583  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  63.85 
 
 
426 aa  582  1e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  8.80013e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  65.35 
 
 
454 aa  584  1e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  62.7 
 
 
428 aa  577  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  63.34 
 
 
433 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  65.88 
 
 
432 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  63.57 
 
 
432 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  63.38 
 
 
425 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  63.87 
 
 
428 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  63.79 
 
 
431 aa  574  1e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  577  1e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  65.03 
 
 
445 aa  577  1e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  62.88 
 
 
433 aa  572  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  61.02 
 
 
430 aa  572  1e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  62.47 
 
 
426 aa  572  1e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  62.73 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  62.47 
 
 
426 aa  572  1e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.5086e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  62.47 
 
 
426 aa  572  1e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.15607e-07  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  61.02 
 
 
435 aa  572  1e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  61.02 
 
 
430 aa  574  1e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  63.11 
 
 
433 aa  573  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  62.04 
 
 
431 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  62.97 
 
 
433 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  63.38 
 
 
430 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  61.72 
 
 
433 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  63.4 
 
 
428 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  64.34 
 
 
429 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  63.4 
 
 
428 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.58341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  62.32 
 
 
427 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  63.17 
 
 
428 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  61.48 
 
 
433 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  62.8 
 
 
428 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  62.97 
 
 
433 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  62.32 
 
 
428 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  62.97 
 
 
433 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.79965e-06  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  63.4 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  63.87 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.81967e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  62.97 
 
 
433 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  63.64 
 
 
428 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.56312e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.51297e-05 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  62.97 
 
 
433 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  61.85 
 
 
427 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  61.92 
 
 
434 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  60.93 
 
 
429 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  61.86 
 
 
438 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  64.1 
 
 
428 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  60.47 
 
 
429 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  62.3 
 
 
436 aa  563  1e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  62.3 
 
 
436 aa  563  1e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  62.56 
 
 
428 aa  564  1e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  61.02 
 
 
430 aa  561  1e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  62.53 
 
 
436 aa  562  1e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  61.16 
 
 
430 aa  561  1e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  61.25 
 
 
433 aa  564  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>