16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0095 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  339  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  80.61 
 
 
165 aa  280  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  66.21 
 
 
231 aa  219  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  38.69 
 
 
1111 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  40 
 
 
1019 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  40 
 
 
1019 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  38.1 
 
 
1111 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  38.1 
 
 
1111 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  38.1 
 
 
1111 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2542  hypothetical protein  39.1 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16342  normal  0.73231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  38.52 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  38.93 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  37.31 
 
 
1114 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3609  hypothetical protein  35.04 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3137  hypothetical protein  34.31 
 
 
192 aa  57.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.179109  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1921  hypothetical protein  32.53 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>