224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0092 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  339  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  88.2 
 
 
161 aa  305  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  57.64 
 
 
161 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  42.76 
 
 
156 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  44.6 
 
 
156 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 
143 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  38.03 
 
 
150 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
139 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  35 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
141 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 
142 aa  94.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
142 aa  94.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.2 
 
 
142 aa  94.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
154 aa  94  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  35.17 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.42 
 
 
144 aa  89  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  35.54 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.68 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  32.31 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.83 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  37.04 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  38.27 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  28.57 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 
213 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  37.36 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  27.54 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  28.39 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  30.33 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  27.54 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  27.54 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  27.54 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  28.36 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  27.54 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.5 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  32.71 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.18 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  41.54 
 
 
134 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  28.69 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.88 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>