More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0088 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  68.81 
 
 
464 aa  655  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  68.36 
 
 
499 aa  657  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  97.59 
 
 
457 aa  923  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  100 
 
 
457 aa  942  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  69.47 
 
 
464 aa  667  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  70.07 
 
 
467 aa  655  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  89.47 
 
 
491 aa  857  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  67.33 
 
 
469 aa  650  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  68.86 
 
 
467 aa  662  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  69.27 
 
 
464 aa  658  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  69.69 
 
 
464 aa  667  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  68.22 
 
 
462 aa  655  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  68.36 
 
 
464 aa  656  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  69.03 
 
 
464 aa  660  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  68.81 
 
 
464 aa  670  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  66.82 
 
 
465 aa  640  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  69.47 
 
 
464 aa  669  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  68.36 
 
 
468 aa  658  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  70.68 
 
 
469 aa  667  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  69.53 
 
 
475 aa  651  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  66.89 
 
 
478 aa  641  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  69.03 
 
 
464 aa  660  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  68.36 
 
 
466 aa  659  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  65.49 
 
 
468 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  67.87 
 
 
467 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  64.69 
 
 
468 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  5.98016e-12 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  63.92 
 
 
471 aa  601  1e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  63.78 
 
 
462 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  64.55 
 
 
463 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  62.58 
 
 
476 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  63.94 
 
 
467 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  62.23 
 
 
472 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  63.15 
 
 
468 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  61.79 
 
 
472 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  63.25 
 
 
471 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  63.31 
 
 
470 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 
469 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  62.66 
 
 
471 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
489 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  64.02 
 
 
465 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 
465 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  583  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  582  1e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
469 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
490 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  61.94 
 
 
469 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  61.94 
 
 
469 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  62.02 
 
 
469 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  60.78 
 
 
486 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  61.94 
 
 
469 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  60.78 
 
 
486 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  62.16 
 
 
469 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 
468 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  60.99 
 
 
485 aa  576  1e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 
490 aa  577  1e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  61.94 
 
 
469 aa  577  1e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  61.14 
 
 
469 aa  577  1e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  60.34 
 
 
493 aa  577  1e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  60.36 
 
 
468 aa  574  1e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  61.2 
 
 
458 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  59.69 
 
 
485 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 
458 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  3.46068e-07 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 
469 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  57.91 
 
 
461 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 
483 aa  563  1e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  58.44 
 
 
458 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  57.78 
 
 
458 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  58.98 
 
 
458 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 
462 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 
462 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  57.88 
 
 
476 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  57.56 
 
 
458 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  57.33 
 
 
458 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  58.09 
 
 
488 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 
464 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.75067e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 
460 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  54.85 
 
 
478 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  56.24 
 
 
466 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
459 aa  507  1e-142  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
461 aa  507  1e-142  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
459 aa  506  1e-142  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  54.77 
 
 
476 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
458 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 
476 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  54.73 
 
 
469 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
464 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 
460 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
456 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
481 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 
466 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
463 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 
463 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
466 aa  493  1e-138  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
493 aa  494  1e-138  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
466 aa  494  1e-138  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
467 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  52.54 
 
 
467 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>