135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0087 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0087  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  201  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0094  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2265  hypothetical protein  80.21 
 
 
99 aa  168  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0523  hypothetical protein  55.68 
 
 
90 aa  112  2e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  5.07577e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  50.59 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  47.62 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  47.62 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3177  hypothetical protein  47.67 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.293941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  47.62 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  45.24 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  4.36986e-06 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  46.51 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  2.42965e-09 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  44.05 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  44.05 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  44.05 
 
 
90 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  44.58 
 
 
90 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0759  hypothetical protein  42.35 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  44.71 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  44.71 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  43.02 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  40.7 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  41.86 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  83.2  1e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  83.2  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  83.2  1e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  83.2  1e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  82.4  2e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  82.4  2e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0908  hypothetical protein  39.29 
 
 
95 aa  81.6  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431969  hitchhiker  0.00353106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  81.3  4e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.08752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3771  hypothetical protein  38.82 
 
 
95 aa  81.3  4e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1162  Fe(II) trafficking protein YggX  42.86 
 
 
105 aa  81.3  4e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  42.05 
 
 
90 aa  79.7  1e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  39.53 
 
 
114 aa  79.3  1e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  42.05 
 
 
90 aa  79  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  78.6  3e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  78.2  4e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  43.18 
 
 
93 aa  78.2  4e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  38.37 
 
 
90 aa  77.8  4e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  77.4  5e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  39.29 
 
 
90 aa  77.8  5e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  77.4  5e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  77  7e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  39.29 
 
 
90 aa  77  7e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  77  7e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  41.18 
 
 
91 aa  76.3  1e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  40.7 
 
 
90 aa  75.5  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  75.9  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  37.21 
 
 
93 aa  75.1  3e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  40.91 
 
 
89 aa  75.1  3e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  74.3  4e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  74.7  4e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  41.86 
 
 
91 aa  74.7  4e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2250  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  74.3  5e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.76973e-07 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  36.05 
 
 
91 aa  73.9  6e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  34.09 
 
 
90 aa  73.2  1e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  34.09 
 
 
90 aa  73.2  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  34.88 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  71.6  3e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  38.1 
 
 
89 aa  71.6  3e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  36.05 
 
 
90 aa  71.2  4e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1057  hypothetical protein  34.41 
 
 
105 aa  71.2  4e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.977359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  44.12 
 
 
90 aa  70.9  6e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  1.18597e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5276  Fe(II) trafficking protein YggX  37.93 
 
 
91 aa  70.1  9e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  36.9 
 
 
89 aa  70.1  9e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  37.21 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  36.9 
 
 
88 aa  69.3  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2437  hypothetical protein  36.05 
 
 
92 aa  70.1  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1521  hypothetical protein  37.66 
 
 
113 aa  69.3  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1426  hypothetical protein  37.66 
 
 
92 aa  69.3  2e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  42.47 
 
 
90 aa  69.3  2e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  34.88 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  34.88 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  40.85 
 
 
90 aa  67.4  6e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  36.9 
 
 
91 aa  67  7e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  37.8 
 
 
88 aa  66.2  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0938  hypothetical protein  33.73 
 
 
90 aa  63.9  7e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  62.8  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.38126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  61.2  4e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  60.8  6e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  30.68 
 
 
90 aa  60.1  9e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  30.23 
 
 
91 aa  59.7  1e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  31.82 
 
 
90 aa  60.1  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  9.20147e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  31.82 
 
 
90 aa  58.9  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3367  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  59.3  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0165991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0881  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  58.5  3e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3408  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  58.5  3e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.070297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3285  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200191  normal  0.033805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3275  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3454  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.811336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>