137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0082 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0082  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  100 
 
 
205 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0088  2OG-Fe(II) oxygenase  90.36 
 
 
208 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  70.56 
 
 
212 aa  286  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  44.62 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  46.73 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  40.41 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3800  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  44.04 
 
 
200 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.173754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  40.21 
 
 
202 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  40.7 
 
 
210 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21250  hypothetical protein  37.56 
 
 
200 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0845  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  43.2 
 
 
203 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  41.8 
 
 
191 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03669  alkylated DNA repair protein  43.27 
 
 
213 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2055  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.81 
 
 
204 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577188  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1815  hypothetical protein  35.92 
 
 
200 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  39.11 
 
 
202 aa  141  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  42.94 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000801  alkylated DNA repair protein  42.11 
 
 
202 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000943917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  41.76 
 
 
217 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0448  2OG-Fe(II) oxygenase  40.7 
 
 
210 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  40.7 
 
 
197 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  37.79 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0624  alkylated DNA repair protein  38.37 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.137834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  40.12 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  43.27 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2547  2OG-Fe(II) oxygenase  35.67 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  36.32 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1341  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.80983  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0324  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0601  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0998792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0967  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2489  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  42.01 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1300  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1228  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.01 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  39.64 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  41.81 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0575  DNA repair system specific for alkylated DNA  39.26 
 
 
194 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1061  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.52 
 
 
214 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0885098  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1506  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.46 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224685  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  41.62 
 
 
217 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5080  2OG-Fe(II) oxygenase  40.23 
 
 
196 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368788  normal  0.341703 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06700  hypothetical protein  39.53 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  41.04 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1852  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.83 
 
 
203 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  normal  0.0270125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4807  2OG-Fe(II) oxygenase  41.57 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143026  hitchhiker  0.00100646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  38.51 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13141  alkylated DNA repair protein  36.17 
 
 
201 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.249611 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  40.24 
 
 
211 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
255 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1802  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.5 
 
 
194 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.431836  normal  0.363902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3651  2OG-Fe(II) oxygenase  40.72 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4716  2OG-Fe(II) oxygenase  40.72 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5584  2OG-Fe(II) oxygenase  40.72 
 
 
199 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.85 
 
 
141 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3106  2OG-Fe(II) oxygenase  37.28 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0944  2OG-Fe(II) oxygenase  38.69 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3443  2OG-Fe(II) oxygenase  40.51 
 
 
244 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0935  2OG-Fe(II) oxygenase  40.51 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3568  2OG-Fe(II) oxygenase  38.41 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  36.02 
 
 
231 aa  118  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1098  alkylated DNA repair protein  37.65 
 
 
182 aa  118  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  34.42 
 
 
208 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0969  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.51 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395263  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0919  2OG-Fe(II) oxygenase  39.24 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0520  2OG-Fe(II) oxygenase  42.07 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106876  normal  0.285035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0933  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  39.87 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3371  Alkylated DNA repair protein-like protein  39.24 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.647547  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0931  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  39.87 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07531  alkylated DNA repair protein  37.35 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0198174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3624  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  42.45 
 
 
335 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  33.15 
 
 
208 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9147  predicted protein  38.3 
 
 
134 aa  95.9  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0742742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  30.86 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0294  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.97 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0644352  normal  0.158325 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0326  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.77 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00021613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5209  2OG-Fe(II) oxygenase  31.21 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000059446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44026  predicted protein  31.36 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26042  predicted protein  26.14 
 
 
426 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00881  CUE domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15410)  31.82 
 
 
448 aa  61.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1203  putative alkylated DNA repair protein  26.74 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4812  hypothetical protein  24.71 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3958  putative alkylated DNA repair protein  23.81 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662565  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11019  hypothetical protein  33.68 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156547  normal  0.479084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1259  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  37.11 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.802283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1921  hypothetical protein  24.42 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4046  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.03 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4278  hypothetical protein  25.58 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4364  hypothetical protein  25.58 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0439299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4657  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  25.58 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5351  putative alkylated DNA repair protein  35.64 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568532  normal  0.707533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0802  putative alkylated DNA repair protein  26.16 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0671  putative alkylated DNA repair protein  26.44 
 
 
227 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.22017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2137  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  24.12 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0179753  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1653  putative alkylated DNA repair protein  32.56 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0185  hypothetical protein  24.1 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11770  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  23.08 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2216  putative alkylated DNA repair protein  22.94 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.0170627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3962  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  27.84 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.257753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>